Ua ʻike paha ʻoe i ka loaʻa ʻana o kahi lāʻau lapaʻau hou ma waena o 10 a 15 mau makahiki a he mau piliona kālā? ʻO ka nui o ka manawa, ke kālā, a me ka hoʻoikaika ʻana he nui, akā ke hoʻololi nei nā mea a pau i ka hoʻopaʻi ʻepekema i kapa ʻia ʻo chemoinformatics.He aha ia a pehea e kōkua ai i ka ʻike ʻana i nā lāʻau lapaʻau houʻO ka pane e like me ka paʻakikī, a ma kēia pou e wehewehe mākou ma ke ala maʻalahi.
He aha ka cheminformatics? ʻO ka hui pū ʻana o ke kemika a me ka ʻepekema kamepiula
E hoʻomaopopo He aha ka cheminformatics?E noʻonoʻo pono ʻoe e ʻimi i kahi kī kū hoʻokahi e wehe i kahi laka paʻakikī. Akā ua hūnā ʻia ke kī ma waena o kahi mauna he ʻumi piliona mau kī like ʻole. He hana nui! Hiki iā ʻoe ke noʻonoʻo i ka nui o ka manawa a me ka hoʻoikaika ʻana e huli lima a hoʻāʻo i kēlā me kēia kī pākahi?
ʻAe, ke kū nei ka ʻoihana lāʻau lapaʻau i kēia pilikia nui. Hōʻike ka laka i kahi protein e hoʻoulu ai i ka maʻi, a ʻo ke kī he mole kemika hiki ke hoʻololi ʻia i lāʻau lapaʻau. No nā makahiki he nui, Ua hoʻohana ka poʻe loea i nā ʻōnaehana 'manual' e ʻimi i kēlā me kēia lāʻau lapaʻau hou, hoʻolilo i ka nui maoli o ka manawa, ke kālā a me ka hoʻoikaika.
Ke hoʻi nei i ka hoʻohālikelike, e noʻonoʻo ʻoe i kēia manawa he a ʻōnaehana akamai Hiki iā ia ke hoʻoholo koke i ʻeiwa o nā kī he ʻumi i kūpono ʻole. Kōkua pū ka ʻōnaehana iā ʻoe e wānana i nā kī i ʻoi aku ka maikaʻi o ke ʻano, hōʻiliʻili iā lākou, a hoʻokaʻawale iā lākou i mau pūʻulu. Nui! ʻO ia, ma ke ʻano, ke kilokilo o Cheminformatics.
He aha ka cheminformatics? Wahi a ka puka PubMed, 'he kahua o ka 'ike loea e kālele ana i ka 'ohi, mālama, kālailai, a me ka hooponopono 'ikepili kemika.' ʻO kēia aʻo ʻepekema hoʻohana i ka ʻepekema kamepiula a me nā ʻenehana ʻepekema data e hoʻoponopono i nā pilikia paʻakikī i ka kemikaHoʻopili nui ʻia i ka ʻike ʻana i ka lāʻau lapaʻau, akā loaʻa pū kekahi i nā noi ma nā ʻāpana he nui (agrochemicals, food, etc.).
ʻElua mau pou kumu: ʻIkepili a me Algorithms
No ka hoʻomaopopo ʻana i ka hana ʻana o nā cheminformatics, pono mākou e kamaʻilio e pili ana i kāna mau mea pono ʻelua: ʻikepili kemika, ma kekahi aoao, a me ka nā algorithms a me nā hiʻohiʻona, ma ka lima ʻē aʻe. Hoʻohana ʻia nā mea hope e hoʻoponopono i ka ʻikepili kemika a no laila e loaʻa ai ka ʻike kūpono e hiki ai ke hoʻonui i ka hoʻomohala lāʻau. No ka hana ʻana i kēia, pono mua e hoʻokaʻawale i nā ʻikepili āpau e pili ana i kēlā me kēia pūhui kemika.
No laila, hoʻomaka nā mea a pau me ka digitalization o nā moleHiki ke hōʻike ʻia kēia mau mea ma ke kikohoʻe me ka hoʻohana ʻana i nā palapala kūikawā (e like me SMILES, InChI, a i ʻole nā faila SDF) i hiki i ke kamepiula ke hoʻomaopopo a hana. ʻOiaʻiʻo, ʻaʻole mākou e kamaʻilio e pili ana i nā kaha kiʻi maʻalahi: ua hoʻopili kēia mau faila i ka ʻike e like me nā atoms, kā lākou mau mea paʻa, ko lākou ʻano ʻekolu-dimensional, ka hoʻoili uila, nā waiwai kino, a me nā mea ʻē aʻe.
- Ke lawe ʻia nā pūhui kemika, me ko lākou mau ʻano āpau, i ka mokulele kikohoʻe, hiki ke hoʻopili i nā mea hana helu iā lākou.
- ʻO kēia ka mea cheminformatics e pili ana: ka hoʻohana ʻana i ka ʻikepili kemika helu helu, ka ke aʻo ʻana i ka mīkini, naʻauao hana, ʻimi ʻikepili a me nā ʻano hana ʻike kumu.
- ʻO kēia mau algorithm a me nā hiʻohiʻona e wikiwiki loa i ka nānā ʻana i ka nui o ka ʻikepili, me ka pahuhopu hope loa o ka hoʻomohala ʻana i nā lāʻau lapaʻau.
Pehea e kōkua ai nā cheminformatics e ʻike i nā lāʻau lapaʻau hou
ʻO ke kumu, he aha ka cheminformatics e hana ai hoʻonui i kēlā me kēia pae o ka ʻike ʻana i ka lāʻau a me ke kaʻina hana hoʻomohalaHe mea pono ke hoʻomaopopo he pōʻaiapuni lōʻihi a paʻakikī kēia kaʻina e hiki ke lawe i 10 a 15 mau makahiki a lilo i mau piliona kālā. Akā ʻo ka hapa nui o kēia hoʻoikaika ʻana ua maʻalahi loa ma muli o ka hui ʻana o ke kemika a me ka ʻepekema kamepiula. E nānā kākou pehea e hiki ai kēia i ka wā mua o ka hoʻomohala ʻana i ka lāʻau lapaʻau.
Papa 1: ʻIke a me ka Noʻonoʻo
No ka hana ʻana i lāʻau lapaʻau, ʻo ka mea mua a ka poʻe ʻepekema e noiʻi ai i ke kumu o ka maʻi. I loko o ia kumu, Hoʻomaopopo lākou i kahi pahuhopu olaola a i ʻole pahuhopu (e like me ka protein a i ʻole ka gene) hiki ke hoʻololi ʻia e mālama i ka maʻi.. I kēia manawa, kōkua nā cheminformatics e ʻike inā he "druggable" kahi pahuhopu, ʻo ia hoʻi, inā he ʻūmiʻi (e hoʻi ana i ka hoʻohālikelike mua) i mea e hoʻokomo ai i a kī (mole) e ho'āʻo e hoʻololi.
Eia kekahi, kōkua pū nā ʻenehana hana ʻikepili i hoʻomaopopo a hana i nā molekele moho (hui kī) hiki ke launa pū me ka pahuhopu. Ma kahi o ka hoʻāʻo kino ʻana i nā miliona o nā pūhui, a hoʻopaʻa ʻike maka i nā ʻikepili nui e ʻike i nā moho maikaʻi loa. No laila, ʻo ka mea ma mua o ʻelua a ʻehā mau makahiki i kēia manawa ua hoʻokō ʻia i ka manawa liʻiliʻi a me ka liʻiliʻi o ke kālā a me ka hoʻoikaika.
Māhele 2: Māhele preclinical
Ma ka pae preclinical, lawe ʻia nā mea hoʻohiki maikaʻi loa i ʻike ʻia a hoʻopaʻa ʻia e loiloi i ko lākou palekana a me ka pono. Hana ʻia kēia mau haʻawina i nā mea ʻelua i loko o ka lumi hoʻomoʻa (ma nā pūnaewele a me nā ʻiʻo) e like me i loko o ke ola (i nā holoholona). Akā, Hiki i nā Chemoinformatics ke hoʻohālikelike i kēia mau haʻawina i loko o ka silico, ʻo ia hoʻi, ma ke kamepiula, a me nā hopena like loa me nā hoʻokolohua hoʻokolohua. Ma keʻano maʻamau, mālama kēia i nā kumuwaiwai a me ka manawa, a pale i ka synthesizing i nā haneli o nā ʻano like ʻole.
'anuʻu 3: Nā hana hoʻokolohua lapaʻau
Inā kūleʻa nā haʻawina preclinical, neʻe ka pūhui i ka hoʻāʻo kanaka. ʻOiaʻiʻo, ʻoi aku ka ikaika o ia pūhui i loko o kahi paipu hoʻāʻo a i ʻole i ka simulation kikohoʻe. Akā inā ʻaʻole e komo ke kino o ke kanaka, he mea ʻawaʻawa ia, a i ʻole e hoʻololi koke ʻia e ke akepaʻa, he lāʻau ʻole ia. No laila, ma mua o ka hoʻāʻo ʻana i ke kanaka, pono e hana i kahi ADMET Properties Prediction Test, e ana ana i ka Adsorption, Distribution, Metabolism, Excretion and Toxicity o ka hui i loko o ke kino kanaka.
ʻO ka mea pōmaikaʻi, Hiki i nā kumu hoʻohālike kemika ke holo i nā hōʻike wānana waiwai ADMETHiki ke hana i kēia ma mua o ka hoʻāʻo ʻana i ka pūhui i nā holoholona, i mea e hoʻoholo ai i nā moho pilikia i ka wā mua. Eia hou, ʻo ka hana ʻana i kēia mau hoʻohālikelike kikohoʻe e hōʻemi i ka nui o nā hoʻokolohua lapaʻau i hāʻule ʻole, a me ka pono e hoʻohana i nā kumuhana hoʻāʻo (a me ka hopena o ka hopena etika).
I ka hopena, ua ʻike mākou ma nā ʻāpana ākea he aha nā chemoinformatics a pehea e kōkua ai i ka ʻike ʻana i nā lāʻau lapaʻau hou. Nui ka scalability o kēia ʻano ʻepekema., no laila e manaʻo ʻia nā hopena hou aʻe a maikaʻi aʻe i ka wā e hiki mai ana. Ma ka hoʻohui ʻana i ka mana o ke kemika me ka naʻauao helu, ua wehe ʻia ke ao holoʻokoʻa o nā mea hiki ke mālama i nā maʻi me ka wikiwiki, pololei, a me ka waiwai.
Mai koʻu wā ʻōpiopio mai, ua hoihoi au i nā mea ʻepekema a me nā ʻenehana āpau, ʻoiai hoʻi nā holomua e maʻalahi ai a ʻoi aku ka leʻaleʻa o ko kākou ola. Makemake au e noho hou i nā nūhou a me nā ʻano hou loa, a e kaʻana like i kaʻu mau ʻike, nā manaʻo, a me nā ʻōlelo aʻoaʻo e pili ana i nā hāmeʻa a me nā hāmeʻa aʻu e hoʻohana nei. Ua alakaʻi kēia iaʻu e lilo i mea kākau pūnaewele ma mua o ʻelima mau makahiki i hala aku nei, e kālele ana i nā polokalamu Android a me nā ʻōnaehana hana Windows. Ua aʻo wau e wehewehe i nā manaʻo paʻakikī ma nā ʻōlelo maʻalahi i hiki i kaʻu poʻe heluhelu ke hoʻomaopopo maʻalahi iā lākou.